1、 组建设计团队：包括建筑设计师、实验动物专家、动物实验室使用者代表、动物实验室管理者。
2、 信息收集：对将要建设的动物实验室准备进行的动物种类及数量、微生物类型、试验性质等进行详细的前期调研工作。实验动物科学正逐步走入正规化和法制化，因此，设计团队一定要熟读有关实验动物的国标、行标及生物安全等有关规范。
3、 参观考察：有目的有重点的参观同类相关设施，采纳经验、吸取教训。甚至可以通过因特网（Internet）了解当今国外先进的动物实验设施。
4、 微生物危害评估Risk Assessment：当建设使用传染性或有潜在传染性材料的动物实验室前，必须进行微生物危害评估。评估内容包括：微生物的致病性（致病方式、致病程度）、致病途径、稳定性、致病剂量、操作时的浓度，除此以外，目标微生物是否有有效的预防和治疗方法、操作者的专业水平及技能也是评估内容。根据微生物危害评估结果，参照国际或国家的《微生物危害分类标准》，确定目标微生物应在哪一级的生物安全防护实验室中进行。
5、 定位要清楚：在立项建造生物安全动物实验室前，首先应对实验室的主要用途、基本的性能指标以及建造实验室的目的等有透彻的了解。要根据试验对象的危害性确定生物安全动物实验室的等级，不能盲目地追求高等级，因为级别越高，建造和运行费用也越高。选择合理、经济的设计方案，要兼顾初投资和运行费用。对于高级别的生物安全动物实验室（三级和四级），由于其造价昂贵，不宜盲目攀比建设，避免造成浪费。
6、 论证咨询和施工合作：从方案设计到论证施工,这期间动物实验室经营管理者要经过大量的调研工作和资料查阅,提出具体方案,并聘请实验动物专家为技术顾问，同设计单位进行密切沟通与合作、多方征询有关专家的意见；平面图设计好后，应该请实验动物学专家进行论证，论证设计图的人流、物流、气流的走向是否合理，以及设计是否达到实验动物国标的要求。